За неуплату налогов в особо крупном размере региональное отделение СКР возбудило уголовное дело в отношении руководства АО и ООО «Пермский свинокомплекс». В административных помещениях комплекса прошли обыски и изъята бухгалтерская документация.
По версии следствия, общество осуществляло хозяйственную деятельность, минуя расчетный счет предприятия.
Сельскохозяйственное предприятие ежегодно производит 18—21 тыс. тонн свинины в живом весе. При этом оно имеет задолженности перед «Газпром межрегионгаз Пермь» — 43,4 млн руб., перед пенсионным фондом — 72 млн руб. Одноименное акционерное общество задолжало ПФР 37 млн руб. Согласно отчетности АО, кредиторская задолженность общества в 2015 году составила 743,511 млн руб.